Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn23Q9D7D7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn23Q9D7D7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms