Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce1Q9D720 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms