Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nop56Q9D6Z1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nop56Q9D6Z1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nop56Q9D6Z1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nop56Q9D6Z1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nop56Q9D6Z1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nop56Q9D6Z1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nop56Q9D6Z1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nop56Q9D6Z1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nop56Q9D6Z1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nop56Q9D6Z1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nop56Q9D6Z1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nop56Q9D6Z1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nop56Q9D6Z1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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