Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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MsraQ9D6Y7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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MsraQ9D6Y7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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MsraQ9D6Y7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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MsraQ9D6Y7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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MsraQ9D6Y7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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MsraQ9D6Y7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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MsraQ9D6Y7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MsraQ9D6Y7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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