Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms