Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc81Q9D5W4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc81Q9D5W4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms