Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PrameQ9D4Z5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PrameQ9D4Z5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PrameQ9D4Z5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms