Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930564D02RikQ9D4S4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms