Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms