Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt20Q9D312 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt20Q9D312 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt20Q9D312 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt20Q9D312 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt20Q9D312 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Krt20Q9D312 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Krt20Q9D312 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Krt20Q9D312 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Krt20Q9D312 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt20Q9D312 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt20Q9D312 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Krt20Q9D312 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Krt20Q9D312 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Krt20Q9D312 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt20Q9D312 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms