Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Mrpl28Q9D1B9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Mrpl28Q9D1B9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Mrpl28Q9D1B9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Mrpl28Q9D1B9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Mrpl28Q9D1B9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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