Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Mms19Q9D071 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Mms19Q9D071 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Mms19Q9D071 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mms19Q9D071 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mms19Q9D071 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mms19Q9D071 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mms19Q9D071 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mms19Q9D071 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mms19Q9D071 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mms19Q9D071 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mms19Q9D071 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mms19Q9D071 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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