Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl11Q9CXW4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms