Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms