Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg12Q9CQY1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms