Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chchd5Q9CQP3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms