Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms