Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms