Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms