Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NsmfQ99NF2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NsmfQ99NF2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms