Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac9Q99N13 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdac9Q99N13 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms