Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms