Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms