Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms