Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms