Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RtcbQ99LF4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RtcbQ99LF4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms