Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps4Q99KG7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms