Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TrabdQ99JY4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TrabdQ99JY4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TrabdQ99JY4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TrabdQ99JY4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TrabdQ99JY4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TrabdQ99JY4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TrabdQ99JY4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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