Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lims1Q99JW4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lims1Q99JW4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lims1Q99JW4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lims1Q99JW4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lims1Q99JW4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lims1Q99JW4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lims1Q99JW4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lims1Q99JW4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms