Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pacsin3Q99JB8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pacsin3Q99JB8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms