Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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