Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf144aQ925F3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf144aQ925F3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms