Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim59Q922Y2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms