Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb6Q922F4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms