Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf7Q922B6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf7Q922B6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms