Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Afg3l1Q920A7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Afg3l1Q920A7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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Afg3l1Q920A7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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Afg3l1Q920A7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Afg3l1Q920A7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Afg3l1Q920A7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Afg3l1Q920A7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Afg3l1Q920A7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Afg3l1Q920A7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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