Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csde1Q91W50 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms