Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps3Q91VB4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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