Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Stx18Q8VDS8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms