Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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GcaQ8VC88 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GcaQ8VC88 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GcaQ8VC88 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms