Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7N6

Traf3ip2, TRAF3-interacting protein 2, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip2Q8N7N6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip2Q8N7N6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3ip2Q8N7N6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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