Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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