Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms