Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms