Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc4a8Q8JZR6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc4a8Q8JZR6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms