Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip3Q8CHD8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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