Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ercc8Q8CFD5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ercc8Q8CFD5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ercc8Q8CFD5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ercc8Q8CFD5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ercc8Q8CFD5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ercc8Q8CFD5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ercc8Q8CFD5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
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