Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms