Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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