Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms